Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PCGF6Q9BYE7 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PCGF6Q9BYE7 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PCGF6Q9BYE7 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PCGF6Q9BYE7 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PCGF6Q9BYE7 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PCGF6Q9BYE7 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PCGF6Q9BYE7 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PCGF6Q9BYE7 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
PCGF6Q9BYE7 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PCGF6Q9BYE7 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PCGF6Q9BYE7 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PCGF6Q9BYE7 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PCGF6Q9BYE7 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PCGF6Q9BYE7 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms