Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms