Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RSPO3Q9BXY4 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms