Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms