Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC7Q96M83 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms