Protein–RNA interactions for Protein: Q96IL0

APOPT1, Apoptogenic protein 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOPT1Q96IL0 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOPT1Q96IL0 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOPT1Q96IL0 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOPT1Q96IL0 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOPT1Q96IL0 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOPT1Q96IL0 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOPT1Q96IL0 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOPT1Q96IL0 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOPT1Q96IL0 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOPT1Q96IL0 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOPT1Q96IL0 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOPT1Q96IL0 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOPT1Q96IL0 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOPT1Q96IL0 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOPT1Q96IL0 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
APOPT1Q96IL0 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOPT1Q96IL0 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOPT1Q96IL0 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOPT1Q96IL0 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOPT1Q96IL0 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOPT1Q96IL0 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOPT1Q96IL0 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
APOPT1Q96IL0 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOPT1Q96IL0 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOPT1Q96IL0 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOPT1Q96IL0 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
APOPT1Q96IL0 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOPT1Q96IL0 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOPT1Q96IL0 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOPT1Q96IL0 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOPT1Q96IL0 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOPT1Q96IL0 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOPT1Q96IL0 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOPT1Q96IL0 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOPT1Q96IL0 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOPT1Q96IL0 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOPT1Q96IL0 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOPT1Q96IL0 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOPT1Q96IL0 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOPT1Q96IL0 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOPT1Q96IL0 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOPT1Q96IL0 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOPT1Q96IL0 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOPT1Q96IL0 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOPT1Q96IL0 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOPT1Q96IL0 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOPT1Q96IL0 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOPT1Q96IL0 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOPT1Q96IL0 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOPT1Q96IL0 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOPT1Q96IL0 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOPT1Q96IL0 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
APOPT1Q96IL0 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOPT1Q96IL0 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOPT1Q96IL0 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOPT1Q96IL0 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOPT1Q96IL0 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOPT1Q96IL0 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOPT1Q96IL0 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOPT1Q96IL0 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOPT1Q96IL0 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
APOPT1Q96IL0 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOPT1Q96IL0 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOPT1Q96IL0 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOPT1Q96IL0 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
APOPT1Q96IL0 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOPT1Q96IL0 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOPT1Q96IL0 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
APOPT1Q96IL0 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOPT1Q96IL0 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOPT1Q96IL0 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOPT1Q96IL0 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOPT1Q96IL0 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOPT1Q96IL0 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOPT1Q96IL0 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOPT1Q96IL0 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOPT1Q96IL0 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOPT1Q96IL0 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOPT1Q96IL0 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOPT1Q96IL0 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOPT1Q96IL0 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOPT1Q96IL0 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOPT1Q96IL0 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOPT1Q96IL0 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOPT1Q96IL0 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOPT1Q96IL0 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOPT1Q96IL0 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOPT1Q96IL0 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOPT1Q96IL0 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOPT1Q96IL0 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOPT1Q96IL0 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOPT1Q96IL0 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOPT1Q96IL0 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOPT1Q96IL0 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOPT1Q96IL0 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOPT1Q96IL0 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOPT1Q96IL0 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOPT1Q96IL0 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOPT1Q96IL0 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOPT1Q96IL0 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms