Protein–RNA interactions for Protein: Q96GY0

ZC2HC1A, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC2HC1AQ96GY0 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZC2HC1AQ96GY0 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZC2HC1AQ96GY0 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZC2HC1AQ96GY0 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZC2HC1AQ96GY0 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZC2HC1AQ96GY0 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZC2HC1AQ96GY0 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZC2HC1AQ96GY0 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZC2HC1AQ96GY0 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZC2HC1AQ96GY0 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZC2HC1AQ96GY0 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZC2HC1AQ96GY0 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZC2HC1AQ96GY0 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZC2HC1AQ96GY0 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZC2HC1AQ96GY0 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZC2HC1AQ96GY0 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZC2HC1AQ96GY0 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZC2HC1AQ96GY0 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZC2HC1AQ96GY0 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZC2HC1AQ96GY0 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZC2HC1AQ96GY0 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZC2HC1AQ96GY0 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZC2HC1AQ96GY0 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZC2HC1AQ96GY0 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZC2HC1AQ96GY0 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZC2HC1AQ96GY0 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZC2HC1AQ96GY0 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZC2HC1AQ96GY0 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZC2HC1AQ96GY0 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZC2HC1AQ96GY0 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZC2HC1AQ96GY0 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ZC2HC1AQ96GY0 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZC2HC1AQ96GY0 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ZC2HC1AQ96GY0 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZC2HC1AQ96GY0 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZC2HC1AQ96GY0 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZC2HC1AQ96GY0 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZC2HC1AQ96GY0 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZC2HC1AQ96GY0 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZC2HC1AQ96GY0 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZC2HC1AQ96GY0 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZC2HC1AQ96GY0 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZC2HC1AQ96GY0 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZC2HC1AQ96GY0 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZC2HC1AQ96GY0 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZC2HC1AQ96GY0 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZC2HC1AQ96GY0 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZC2HC1AQ96GY0 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZC2HC1AQ96GY0 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZC2HC1AQ96GY0 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZC2HC1AQ96GY0 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZC2HC1AQ96GY0 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZC2HC1AQ96GY0 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZC2HC1AQ96GY0 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZC2HC1AQ96GY0 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZC2HC1AQ96GY0 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZC2HC1AQ96GY0 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZC2HC1AQ96GY0 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZC2HC1AQ96GY0 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZC2HC1AQ96GY0 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZC2HC1AQ96GY0 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZC2HC1AQ96GY0 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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ZC2HC1AQ96GY0 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZC2HC1AQ96GY0 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZC2HC1AQ96GY0 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZC2HC1AQ96GY0 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZC2HC1AQ96GY0 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZC2HC1AQ96GY0 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZC2HC1AQ96GY0 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZC2HC1AQ96GY0 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZC2HC1AQ96GY0 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZC2HC1AQ96GY0 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZC2HC1AQ96GY0 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZC2HC1AQ96GY0 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZC2HC1AQ96GY0 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ZC2HC1AQ96GY0 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZC2HC1AQ96GY0 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZC2HC1AQ96GY0 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZC2HC1AQ96GY0 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZC2HC1AQ96GY0 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZC2HC1AQ96GY0 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZC2HC1AQ96GY0 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZC2HC1AQ96GY0 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZC2HC1AQ96GY0 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZC2HC1AQ96GY0 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZC2HC1AQ96GY0 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZC2HC1AQ96GY0 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZC2HC1AQ96GY0 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZC2HC1AQ96GY0 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZC2HC1AQ96GY0 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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