Protein–RNA interactions for Protein: Q96GM5

SMARCD1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD1Q96GM5 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMARCD1Q96GM5 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMARCD1Q96GM5 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMARCD1Q96GM5 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMARCD1Q96GM5 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMARCD1Q96GM5 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMARCD1Q96GM5 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMARCD1Q96GM5 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMARCD1Q96GM5 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMARCD1Q96GM5 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMARCD1Q96GM5 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMARCD1Q96GM5 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMARCD1Q96GM5 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMARCD1Q96GM5 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMARCD1Q96GM5 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMARCD1Q96GM5 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMARCD1Q96GM5 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMARCD1Q96GM5 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMARCD1Q96GM5 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMARCD1Q96GM5 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMARCD1Q96GM5 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMARCD1Q96GM5 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMARCD1Q96GM5 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
SMARCD1Q96GM5 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMARCD1Q96GM5 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMARCD1Q96GM5 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMARCD1Q96GM5 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMARCD1Q96GM5 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMARCD1Q96GM5 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SMARCD1Q96GM5 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMARCD1Q96GM5 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMARCD1Q96GM5 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMARCD1Q96GM5 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMARCD1Q96GM5 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMARCD1Q96GM5 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMARCD1Q96GM5 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMARCD1Q96GM5 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMARCD1Q96GM5 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMARCD1Q96GM5 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCD1Q96GM5 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCD1Q96GM5 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCD1Q96GM5 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCD1Q96GM5 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCD1Q96GM5 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCD1Q96GM5 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCD1Q96GM5 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCD1Q96GM5 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCD1Q96GM5 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCD1Q96GM5 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCD1Q96GM5 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCD1Q96GM5 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCD1Q96GM5 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCD1Q96GM5 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCD1Q96GM5 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCD1Q96GM5 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCD1Q96GM5 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCD1Q96GM5 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCD1Q96GM5 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCD1Q96GM5 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCD1Q96GM5 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCD1Q96GM5 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCD1Q96GM5 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCD1Q96GM5 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCD1Q96GM5 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCD1Q96GM5 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCD1Q96GM5 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCD1Q96GM5 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCD1Q96GM5 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCD1Q96GM5 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCD1Q96GM5 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCD1Q96GM5 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCD1Q96GM5 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCD1Q96GM5 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCD1Q96GM5 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCD1Q96GM5 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCD1Q96GM5 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCD1Q96GM5 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCD1Q96GM5 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCD1Q96GM5 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCD1Q96GM5 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCD1Q96GM5 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCD1Q96GM5 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCD1Q96GM5 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCD1Q96GM5 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCD1Q96GM5 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCD1Q96GM5 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCD1Q96GM5 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCD1Q96GM5 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCD1Q96GM5 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCD1Q96GM5 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCD1Q96GM5 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCD1Q96GM5 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCD1Q96GM5 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCD1Q96GM5 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCD1Q96GM5 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCD1Q96GM5 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCD1Q96GM5 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCD1Q96GM5 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCD1Q96GM5 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMARCD1Q96GM5 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms