Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRUQ92729 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRUQ92729 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRUQ92729 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRUQ92729 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRUQ92729 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRUQ92729 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRUQ92729 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRUQ92729 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRUQ92729 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRUQ92729 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRUQ92729 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRUQ92729 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRUQ92729 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRUQ92729 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRUQ92729 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRUQ92729 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRUQ92729 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRUQ92729 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRUQ92729 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRUQ92729 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRUQ92729 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRUQ92729 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRUQ92729 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRUQ92729 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRUQ92729 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRUQ92729 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRUQ92729 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRUQ92729 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRUQ92729 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRUQ92729 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRUQ92729 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRUQ92729 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRUQ92729 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRUQ92729 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRUQ92729 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRUQ92729 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRUQ92729 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRUQ92729 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRUQ92729 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRUQ92729 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRUQ92729 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRUQ92729 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRUQ92729 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRUQ92729 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRUQ92729 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRUQ92729 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRUQ92729 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRUQ92729 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRUQ92729 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRUQ92729 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRUQ92729 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRUQ92729 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRUQ92729 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRUQ92729 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRUQ92729 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRUQ92729 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRUQ92729 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRUQ92729 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRUQ92729 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRUQ92729 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRUQ92729 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRUQ92729 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRUQ92729 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRUQ92729 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRUQ92729 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRUQ92729 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRUQ92729 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRUQ92729 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRUQ92729 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRUQ92729 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRUQ92729 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRUQ92729 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRUQ92729 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRUQ92729 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRUQ92729 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRUQ92729 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRUQ92729 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRUQ92729 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRUQ92729 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRUQ92729 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRUQ92729 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRUQ92729 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRUQ92729 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRUQ92729 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRUQ92729 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRUQ92729 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRUQ92729 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRUQ92729 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRUQ92729 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRUQ92729 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRUQ92729 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRUQ92729 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRUQ92729 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRUQ92729 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRUQ92729 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRUQ92729 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPRUQ92729 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPRUQ92729 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPRUQ92729 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms