Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ69

C11orf40, Putative uncharacterized protein C11orf40, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf40Q8WZ69 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C11orf40Q8WZ69 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms