Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVD3

RNF138, E3 ubiquitin-protein ligase RNF138, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF138Q8WVD3 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF138Q8WVD3 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF138Q8WVD3 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF138Q8WVD3 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF138Q8WVD3 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF138Q8WVD3 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF138Q8WVD3 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF138Q8WVD3 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF138Q8WVD3 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF138Q8WVD3 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF138Q8WVD3 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF138Q8WVD3 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF138Q8WVD3 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF138Q8WVD3 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF138Q8WVD3 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF138Q8WVD3 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF138Q8WVD3 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF138Q8WVD3 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF138Q8WVD3 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF138Q8WVD3 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF138Q8WVD3 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF138Q8WVD3 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF138Q8WVD3 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF138Q8WVD3 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF138Q8WVD3 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF138Q8WVD3 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF138Q8WVD3 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF138Q8WVD3 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF138Q8WVD3 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF138Q8WVD3 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF138Q8WVD3 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF138Q8WVD3 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF138Q8WVD3 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF138Q8WVD3 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF138Q8WVD3 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF138Q8WVD3 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF138Q8WVD3 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF138Q8WVD3 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF138Q8WVD3 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF138Q8WVD3 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF138Q8WVD3 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF138Q8WVD3 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF138Q8WVD3 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF138Q8WVD3 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF138Q8WVD3 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF138Q8WVD3 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF138Q8WVD3 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF138Q8WVD3 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF138Q8WVD3 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF138Q8WVD3 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF138Q8WVD3 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF138Q8WVD3 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF138Q8WVD3 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF138Q8WVD3 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF138Q8WVD3 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF138Q8WVD3 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF138Q8WVD3 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF138Q8WVD3 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF138Q8WVD3 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF138Q8WVD3 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF138Q8WVD3 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF138Q8WVD3 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF138Q8WVD3 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF138Q8WVD3 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF138Q8WVD3 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF138Q8WVD3 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF138Q8WVD3 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF138Q8WVD3 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF138Q8WVD3 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF138Q8WVD3 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF138Q8WVD3 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF138Q8WVD3 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF138Q8WVD3 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF138Q8WVD3 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF138Q8WVD3 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF138Q8WVD3 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF138Q8WVD3 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF138Q8WVD3 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF138Q8WVD3 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF138Q8WVD3 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF138Q8WVD3 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF138Q8WVD3 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF138Q8WVD3 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF138Q8WVD3 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF138Q8WVD3 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF138Q8WVD3 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF138Q8WVD3 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF138Q8WVD3 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF138Q8WVD3 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF138Q8WVD3 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF138Q8WVD3 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF138Q8WVD3 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF138Q8WVD3 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF138Q8WVD3 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF138Q8WVD3 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF138Q8WVD3 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF138Q8WVD3 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF138Q8WVD3 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF138Q8WVD3 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF138Q8WVD3 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms