Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF397Q8NF99 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF397Q8NF99 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF397Q8NF99 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF397Q8NF99 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF397Q8NF99 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF397Q8NF99 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF397Q8NF99 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF397Q8NF99 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF397Q8NF99 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF397Q8NF99 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF397Q8NF99 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF397Q8NF99 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF397Q8NF99 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF397Q8NF99 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF397Q8NF99 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF397Q8NF99 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF397Q8NF99 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF397Q8NF99 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF397Q8NF99 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF397Q8NF99 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF397Q8NF99 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF397Q8NF99 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF397Q8NF99 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF397Q8NF99 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF397Q8NF99 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF397Q8NF99 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF397Q8NF99 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF397Q8NF99 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF397Q8NF99 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF397Q8NF99 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF397Q8NF99 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF397Q8NF99 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF397Q8NF99 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF397Q8NF99 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF397Q8NF99 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF397Q8NF99 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF397Q8NF99 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF397Q8NF99 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF397Q8NF99 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF397Q8NF99 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF397Q8NF99 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF397Q8NF99 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF397Q8NF99 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF397Q8NF99 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF397Q8NF99 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF397Q8NF99 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF397Q8NF99 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF397Q8NF99 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF397Q8NF99 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF397Q8NF99 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF397Q8NF99 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF397Q8NF99 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF397Q8NF99 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF397Q8NF99 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF397Q8NF99 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF397Q8NF99 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF397Q8NF99 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF397Q8NF99 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF397Q8NF99 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF397Q8NF99 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF397Q8NF99 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF397Q8NF99 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF397Q8NF99 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF397Q8NF99 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF397Q8NF99 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF397Q8NF99 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF397Q8NF99 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF397Q8NF99 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF397Q8NF99 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF397Q8NF99 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF397Q8NF99 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF397Q8NF99 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF397Q8NF99 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF397Q8NF99 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF397Q8NF99 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF397Q8NF99 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF397Q8NF99 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF397Q8NF99 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF397Q8NF99 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF397Q8NF99 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF397Q8NF99 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF397Q8NF99 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF397Q8NF99 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF397Q8NF99 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF397Q8NF99 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF397Q8NF99 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF397Q8NF99 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF397Q8NF99 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF397Q8NF99 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF397Q8NF99 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF397Q8NF99 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF397Q8NF99 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF397Q8NF99 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF397Q8NF99 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF397Q8NF99 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF397Q8NF99 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF397Q8NF99 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF397Q8NF99 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF397Q8NF99 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms