Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8Q8

COX18, Mitochondrial inner membrane protein COX18, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX18Q8N8Q8 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COX18Q8N8Q8 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COX18Q8N8Q8 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COX18Q8N8Q8 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COX18Q8N8Q8 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COX18Q8N8Q8 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COX18Q8N8Q8 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COX18Q8N8Q8 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COX18Q8N8Q8 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COX18Q8N8Q8 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COX18Q8N8Q8 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COX18Q8N8Q8 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COX18Q8N8Q8 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COX18Q8N8Q8 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COX18Q8N8Q8 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COX18Q8N8Q8 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COX18Q8N8Q8 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COX18Q8N8Q8 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
COX18Q8N8Q8 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
COX18Q8N8Q8 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
COX18Q8N8Q8 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
COX18Q8N8Q8 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
COX18Q8N8Q8 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
COX18Q8N8Q8 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
COX18Q8N8Q8 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
COX18Q8N8Q8 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
COX18Q8N8Q8 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
COX18Q8N8Q8 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
COX18Q8N8Q8 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
COX18Q8N8Q8 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX18Q8N8Q8 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX18Q8N8Q8 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX18Q8N8Q8 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX18Q8N8Q8 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX18Q8N8Q8 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX18Q8N8Q8 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX18Q8N8Q8 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX18Q8N8Q8 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX18Q8N8Q8 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX18Q8N8Q8 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX18Q8N8Q8 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
COX18Q8N8Q8 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX18Q8N8Q8 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX18Q8N8Q8 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX18Q8N8Q8 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX18Q8N8Q8 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX18Q8N8Q8 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
COX18Q8N8Q8 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
COX18Q8N8Q8 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
COX18Q8N8Q8 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX18Q8N8Q8 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX18Q8N8Q8 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX18Q8N8Q8 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX18Q8N8Q8 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
COX18Q8N8Q8 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX18Q8N8Q8 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX18Q8N8Q8 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX18Q8N8Q8 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX18Q8N8Q8 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX18Q8N8Q8 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX18Q8N8Q8 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX18Q8N8Q8 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX18Q8N8Q8 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX18Q8N8Q8 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX18Q8N8Q8 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX18Q8N8Q8 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX18Q8N8Q8 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX18Q8N8Q8 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX18Q8N8Q8 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX18Q8N8Q8 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX18Q8N8Q8 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX18Q8N8Q8 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX18Q8N8Q8 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX18Q8N8Q8 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX18Q8N8Q8 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX18Q8N8Q8 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX18Q8N8Q8 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX18Q8N8Q8 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX18Q8N8Q8 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX18Q8N8Q8 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX18Q8N8Q8 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX18Q8N8Q8 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX18Q8N8Q8 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX18Q8N8Q8 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX18Q8N8Q8 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX18Q8N8Q8 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX18Q8N8Q8 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX18Q8N8Q8 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
COX18Q8N8Q8 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX18Q8N8Q8 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX18Q8N8Q8 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX18Q8N8Q8 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX18Q8N8Q8 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX18Q8N8Q8 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX18Q8N8Q8 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX18Q8N8Q8 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX18Q8N8Q8 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX18Q8N8Q8 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
COX18Q8N8Q8 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
COX18Q8N8Q8 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms