Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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RNF182Q8N6D2 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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RNF182Q8N6D2 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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RNF182Q8N6D2 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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RNF182Q8N6D2 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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RNF182Q8N6D2 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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RNF182Q8N6D2 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF182Q8N6D2 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF182Q8N6D2 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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