Protein–RNA interactions for Protein: Q8N402

Putative uncharacterized protein LOC388882, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8N402 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8N402 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8N402 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8N402 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8N402 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8N402 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8N402 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Q8N402 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q8N402 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q8N402 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q8N402 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q8N402 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q8N402 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q8N402 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8N402 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8N402 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q8N402 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q8N402 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q8N402 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8N402 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Q8N402 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8N402 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Q8N402 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Q8N402 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Q8N402 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Q8N402 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Q8N402 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Q8N402 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q8N402 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8N402 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8N402 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8N402 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8N402 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Q8N402 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8N402 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Q8N402 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Q8N402 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8N402 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8N402 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q8N402 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8N402 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Q8N402 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8N402 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Q8N402 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Q8N402 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Q8N402 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8N402 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8N402 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8N402 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8N402 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8N402 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8N402 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8N402 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8N402 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8N402 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Q8N402 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8N402 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Q8N402 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Q8N402 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Q8N402 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
Q8N402 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
Q8N402 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Q8N402 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Q8N402 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Q8N402 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Q8N402 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Q8N402 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8N402 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8N402 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8N402 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8N402 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q8N402 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8N402 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8N402 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Q8N402 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8N402 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8N402 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8N402 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8N402 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8N402 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Q8N402 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8N402 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8N402 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8N402 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Q8N402 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8N402 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8N402 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8N402 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8N402 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Q8N402 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q8N402 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8N402 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8N402 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q8N402 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Q8N402 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8N402 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q8N402 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8N402 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Q8N402 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Q8N402 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms