Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ3

C9orf40, Uncharacterized protein C9orf40, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40Q8IXQ3 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf40Q8IXQ3 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf40Q8IXQ3 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf40Q8IXQ3 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf40Q8IXQ3 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf40Q8IXQ3 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf40Q8IXQ3 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf40Q8IXQ3 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf40Q8IXQ3 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf40Q8IXQ3 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf40Q8IXQ3 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf40Q8IXQ3 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf40Q8IXQ3 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf40Q8IXQ3 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf40Q8IXQ3 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf40Q8IXQ3 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf40Q8IXQ3 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf40Q8IXQ3 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf40Q8IXQ3 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf40Q8IXQ3 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf40Q8IXQ3 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf40Q8IXQ3 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf40Q8IXQ3 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf40Q8IXQ3 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf40Q8IXQ3 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf40Q8IXQ3 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf40Q8IXQ3 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf40Q8IXQ3 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf40Q8IXQ3 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf40Q8IXQ3 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf40Q8IXQ3 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf40Q8IXQ3 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf40Q8IXQ3 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf40Q8IXQ3 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf40Q8IXQ3 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf40Q8IXQ3 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf40Q8IXQ3 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf40Q8IXQ3 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf40Q8IXQ3 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf40Q8IXQ3 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf40Q8IXQ3 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf40Q8IXQ3 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf40Q8IXQ3 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf40Q8IXQ3 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf40Q8IXQ3 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf40Q8IXQ3 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf40Q8IXQ3 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf40Q8IXQ3 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf40Q8IXQ3 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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C9orf40Q8IXQ3 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf40Q8IXQ3 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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C9orf40Q8IXQ3 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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C9orf40Q8IXQ3 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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C9orf40Q8IXQ3 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf40Q8IXQ3 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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C9orf40Q8IXQ3 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf40Q8IXQ3 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf40Q8IXQ3 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf40Q8IXQ3 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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C9orf40Q8IXQ3 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf40Q8IXQ3 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf40Q8IXQ3 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf40Q8IXQ3 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf40Q8IXQ3 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf40Q8IXQ3 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf40Q8IXQ3 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf40Q8IXQ3 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf40Q8IXQ3 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf40Q8IXQ3 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf40Q8IXQ3 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf40Q8IXQ3 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf40Q8IXQ3 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf40Q8IXQ3 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf40Q8IXQ3 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf40Q8IXQ3 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf40Q8IXQ3 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf40Q8IXQ3 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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