Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT28Q7Z3Y7 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms