Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ0

TMIGD1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1Q6UXZ0 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMIGD1Q6UXZ0 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms