Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB30

CSAG1, Putative chondrosarcoma-associated gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1Q6PB30 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
CSAG1Q6PB30 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
CSAG1Q6PB30 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
CSAG1Q6PB30 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
CSAG1Q6PB30 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
CSAG1Q6PB30 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
CSAG1Q6PB30 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
CSAG1Q6PB30 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
CSAG1Q6PB30 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
CSAG1Q6PB30 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
CSAG1Q6PB30 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
CSAG1Q6PB30 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
CSAG1Q6PB30 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
CSAG1Q6PB30 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
CSAG1Q6PB30 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
CSAG1Q6PB30 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
CSAG1Q6PB30 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
CSAG1Q6PB30 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
CSAG1Q6PB30 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
CSAG1Q6PB30 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
CSAG1Q6PB30 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
CSAG1Q6PB30 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
CSAG1Q6PB30 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
CSAG1Q6PB30 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
CSAG1Q6PB30 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
CSAG1Q6PB30 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
CSAG1Q6PB30 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
CSAG1Q6PB30 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
CSAG1Q6PB30 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC8.95□□□□□ -0.98
CSAG1Q6PB30 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
CSAG1Q6PB30 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
CSAG1Q6PB30 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC8.95□□□□□ -0.98
CSAG1Q6PB30 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
CSAG1Q6PB30 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
CSAG1Q6PB30 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC8.95□□□□□ -0.98
CSAG1Q6PB30 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
CSAG1Q6PB30 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
CSAG1Q6PB30 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
CSAG1Q6PB30 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC8.95□□□□□ -0.98
CSAG1Q6PB30 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
CSAG1Q6PB30 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC8.95□□□□□ -0.98
CSAG1Q6PB30 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC8.95□□□□□ -0.98
CSAG1Q6PB30 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
CSAG1Q6PB30 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
CSAG1Q6PB30 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
CSAG1Q6PB30 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC8.95□□□□□ -0.98
CSAG1Q6PB30 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
CSAG1Q6PB30 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
CSAG1Q6PB30 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
CSAG1Q6PB30 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
CSAG1Q6PB30 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC8.95□□□□□ -0.98
CSAG1Q6PB30 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
CSAG1Q6PB30 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
CSAG1Q6PB30 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
CSAG1Q6PB30 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
CSAG1Q6PB30 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
CSAG1Q6PB30 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
CSAG1Q6PB30 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
CSAG1Q6PB30 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.95□□□□□ -0.98
CSAG1Q6PB30 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
CSAG1Q6PB30 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
CSAG1Q6PB30 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
CSAG1Q6PB30 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
CSAG1Q6PB30 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
CSAG1Q6PB30 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
CSAG1Q6PB30 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
CSAG1Q6PB30 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
CSAG1Q6PB30 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
CSAG1Q6PB30 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
CSAG1Q6PB30 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
CSAG1Q6PB30 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
CSAG1Q6PB30 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
CSAG1Q6PB30 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
CSAG1Q6PB30 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
CSAG1Q6PB30 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
CSAG1Q6PB30 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
CSAG1Q6PB30 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
CSAG1Q6PB30 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
CSAG1Q6PB30 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
CSAG1Q6PB30 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
CSAG1Q6PB30 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
CSAG1Q6PB30 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
CSAG1Q6PB30 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
CSAG1Q6PB30 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
CSAG1Q6PB30 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.94□□□□□ -0.98
CSAG1Q6PB30 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
CSAG1Q6PB30 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
CSAG1Q6PB30 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
CSAG1Q6PB30 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
CSAG1Q6PB30 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
CSAG1Q6PB30 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
CSAG1Q6PB30 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
CSAG1Q6PB30 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
CSAG1Q6PB30 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
CSAG1Q6PB30 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
CSAG1Q6PB30 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
CSAG1Q6PB30 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
CSAG1Q6PB30 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
CSAG1Q6PB30 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
CSAG1Q6PB30 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms