Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1M0

SLC27A4, Long-chain fatty acid transport protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A4Q6P1M0 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC27A4Q6P1M0 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC27A4Q6P1M0 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC27A4Q6P1M0 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC27A4Q6P1M0 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC27A4Q6P1M0 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC27A4Q6P1M0 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC27A4Q6P1M0 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC27A4Q6P1M0 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC27A4Q6P1M0 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC27A4Q6P1M0 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC27A4Q6P1M0 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC27A4Q6P1M0 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC27A4Q6P1M0 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC27A4Q6P1M0 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC27A4Q6P1M0 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC27A4Q6P1M0 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC27A4Q6P1M0 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC27A4Q6P1M0 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC27A4Q6P1M0 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC27A4Q6P1M0 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC27A4Q6P1M0 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC27A4Q6P1M0 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC27A4Q6P1M0 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC27A4Q6P1M0 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC27A4Q6P1M0 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC27A4Q6P1M0 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC27A4Q6P1M0 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC27A4Q6P1M0 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC27A4Q6P1M0 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC27A4Q6P1M0 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC27A4Q6P1M0 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC27A4Q6P1M0 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC27A4Q6P1M0 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC27A4Q6P1M0 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC27A4Q6P1M0 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC27A4Q6P1M0 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC27A4Q6P1M0 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC27A4Q6P1M0 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC27A4Q6P1M0 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC27A4Q6P1M0 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC27A4Q6P1M0 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC27A4Q6P1M0 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC27A4Q6P1M0 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC27A4Q6P1M0 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC27A4Q6P1M0 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC27A4Q6P1M0 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC27A4Q6P1M0 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC27A4Q6P1M0 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC27A4Q6P1M0 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC27A4Q6P1M0 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC27A4Q6P1M0 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC27A4Q6P1M0 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC27A4Q6P1M0 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC27A4Q6P1M0 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC27A4Q6P1M0 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC27A4Q6P1M0 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC27A4Q6P1M0 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC27A4Q6P1M0 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC27A4Q6P1M0 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC27A4Q6P1M0 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC27A4Q6P1M0 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC27A4Q6P1M0 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC27A4Q6P1M0 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC27A4Q6P1M0 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC27A4Q6P1M0 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC27A4Q6P1M0 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC27A4Q6P1M0 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC27A4Q6P1M0 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC27A4Q6P1M0 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC27A4Q6P1M0 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC27A4Q6P1M0 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC27A4Q6P1M0 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC27A4Q6P1M0 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC27A4Q6P1M0 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC27A4Q6P1M0 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC27A4Q6P1M0 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC27A4Q6P1M0 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC27A4Q6P1M0 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC27A4Q6P1M0 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC27A4Q6P1M0 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC27A4Q6P1M0 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC27A4Q6P1M0 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC27A4Q6P1M0 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC27A4Q6P1M0 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC27A4Q6P1M0 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC27A4Q6P1M0 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC27A4Q6P1M0 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC27A4Q6P1M0 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC27A4Q6P1M0 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC27A4Q6P1M0 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC27A4Q6P1M0 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC27A4Q6P1M0 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC27A4Q6P1M0 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC27A4Q6P1M0 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC27A4Q6P1M0 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC27A4Q6P1M0 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC27A4Q6P1M0 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC27A4Q6P1M0 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC27A4Q6P1M0 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms