Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CARMIL2Q6F5E8 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms