Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CREB3L3Q68CJ9 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CREB3L3Q68CJ9 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CREB3L3Q68CJ9 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CREB3L3Q68CJ9 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CREB3L3Q68CJ9 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CREB3L3Q68CJ9 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CREB3L3Q68CJ9 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CREB3L3Q68CJ9 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CREB3L3Q68CJ9 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CREB3L3Q68CJ9 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CREB3L3Q68CJ9 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CREB3L3Q68CJ9 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CREB3L3Q68CJ9 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CREB3L3Q68CJ9 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CREB3L3Q68CJ9 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CREB3L3Q68CJ9 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CREB3L3Q68CJ9 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CREB3L3Q68CJ9 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CREB3L3Q68CJ9 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CREB3L3Q68CJ9 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CREB3L3Q68CJ9 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CREB3L3Q68CJ9 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CREB3L3Q68CJ9 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CREB3L3Q68CJ9 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CREB3L3Q68CJ9 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CREB3L3Q68CJ9 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CREB3L3Q68CJ9 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CREB3L3Q68CJ9 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CREB3L3Q68CJ9 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CREB3L3Q68CJ9 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CREB3L3Q68CJ9 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CREB3L3Q68CJ9 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CREB3L3Q68CJ9 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CREB3L3Q68CJ9 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CREB3L3Q68CJ9 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CREB3L3Q68CJ9 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CREB3L3Q68CJ9 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CREB3L3Q68CJ9 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CREB3L3Q68CJ9 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CREB3L3Q68CJ9 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CREB3L3Q68CJ9 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CREB3L3Q68CJ9 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CREB3L3Q68CJ9 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CREB3L3Q68CJ9 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CREB3L3Q68CJ9 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CREB3L3Q68CJ9 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CREB3L3Q68CJ9 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CREB3L3Q68CJ9 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CREB3L3Q68CJ9 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CREB3L3Q68CJ9 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CREB3L3Q68CJ9 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CREB3L3Q68CJ9 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CREB3L3Q68CJ9 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CREB3L3Q68CJ9 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CREB3L3Q68CJ9 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CREB3L3Q68CJ9 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CREB3L3Q68CJ9 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CREB3L3Q68CJ9 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CREB3L3Q68CJ9 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CREB3L3Q68CJ9 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CREB3L3Q68CJ9 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CREB3L3Q68CJ9 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CREB3L3Q68CJ9 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CREB3L3Q68CJ9 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CREB3L3Q68CJ9 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CREB3L3Q68CJ9 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CREB3L3Q68CJ9 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CREB3L3Q68CJ9 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CREB3L3Q68CJ9 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CREB3L3Q68CJ9 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CREB3L3Q68CJ9 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CREB3L3Q68CJ9 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CREB3L3Q68CJ9 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CREB3L3Q68CJ9 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CREB3L3Q68CJ9 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CREB3L3Q68CJ9 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CREB3L3Q68CJ9 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CREB3L3Q68CJ9 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CREB3L3Q68CJ9 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CREB3L3Q68CJ9 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CREB3L3Q68CJ9 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CREB3L3Q68CJ9 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CREB3L3Q68CJ9 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CREB3L3Q68CJ9 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CREB3L3Q68CJ9 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CREB3L3Q68CJ9 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CREB3L3Q68CJ9 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CREB3L3Q68CJ9 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CREB3L3Q68CJ9 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CREB3L3Q68CJ9 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CREB3L3Q68CJ9 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CREB3L3Q68CJ9 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CREB3L3Q68CJ9 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CREB3L3Q68CJ9 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CREB3L3Q68CJ9 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CREB3L3Q68CJ9 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CREB3L3Q68CJ9 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CREB3L3Q68CJ9 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CREB3L3Q68CJ9 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms