Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG16L1Q676U5 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms