Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
WSCD1Q658N2 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
WSCD1Q658N2 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
WSCD1Q658N2 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
WSCD1Q658N2 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
WSCD1Q658N2 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
WSCD1Q658N2 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
WSCD1Q658N2 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
WSCD1Q658N2 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
WSCD1Q658N2 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
WSCD1Q658N2 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
WSCD1Q658N2 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
WSCD1Q658N2 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
WSCD1Q658N2 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
WSCD1Q658N2 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
WSCD1Q658N2 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
WSCD1Q658N2 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
WSCD1Q658N2 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
WSCD1Q658N2 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
WSCD1Q658N2 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
WSCD1Q658N2 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
WSCD1Q658N2 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
WSCD1Q658N2 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
WSCD1Q658N2 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
WSCD1Q658N2 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
WSCD1Q658N2 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
WSCD1Q658N2 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
WSCD1Q658N2 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
WSCD1Q658N2 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
WSCD1Q658N2 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
WSCD1Q658N2 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
WSCD1Q658N2 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
WSCD1Q658N2 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
WSCD1Q658N2 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
WSCD1Q658N2 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
WSCD1Q658N2 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
WSCD1Q658N2 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
WSCD1Q658N2 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
WSCD1Q658N2 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
WSCD1Q658N2 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
WSCD1Q658N2 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
WSCD1Q658N2 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
WSCD1Q658N2 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
WSCD1Q658N2 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
WSCD1Q658N2 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
WSCD1Q658N2 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
WSCD1Q658N2 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
WSCD1Q658N2 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
WSCD1Q658N2 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
WSCD1Q658N2 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
WSCD1Q658N2 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
WSCD1Q658N2 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
WSCD1Q658N2 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
WSCD1Q658N2 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
WSCD1Q658N2 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
WSCD1Q658N2 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
WSCD1Q658N2 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
WSCD1Q658N2 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
WSCD1Q658N2 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
WSCD1Q658N2 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
WSCD1Q658N2 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
WSCD1Q658N2 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
WSCD1Q658N2 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
WSCD1Q658N2 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
WSCD1Q658N2 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
WSCD1Q658N2 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
WSCD1Q658N2 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
WSCD1Q658N2 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
WSCD1Q658N2 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
WSCD1Q658N2 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
WSCD1Q658N2 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
WSCD1Q658N2 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
WSCD1Q658N2 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
WSCD1Q658N2 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
WSCD1Q658N2 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
WSCD1Q658N2 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
WSCD1Q658N2 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
WSCD1Q658N2 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
WSCD1Q658N2 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
WSCD1Q658N2 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
WSCD1Q658N2 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
WSCD1Q658N2 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
WSCD1Q658N2 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
WSCD1Q658N2 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
WSCD1Q658N2 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
WSCD1Q658N2 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
WSCD1Q658N2 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
WSCD1Q658N2 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
WSCD1Q658N2 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
WSCD1Q658N2 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
WSCD1Q658N2 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
WSCD1Q658N2 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
WSCD1Q658N2 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
WSCD1Q658N2 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
WSCD1Q658N2 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
WSCD1Q658N2 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
WSCD1Q658N2 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
WSCD1Q658N2 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
WSCD1Q658N2 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
WSCD1Q658N2 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms