Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWM4

PRAMEF8, PRAME family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF8Q5VWM4 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF8Q5VWM4 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF8Q5VWM4 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF8Q5VWM4 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF8Q5VWM4 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF8Q5VWM4 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF8Q5VWM4 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF8Q5VWM4 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF8Q5VWM4 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF8Q5VWM4 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF8Q5VWM4 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF8Q5VWM4 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF8Q5VWM4 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF8Q5VWM4 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF8Q5VWM4 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF8Q5VWM4 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF8Q5VWM4 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF8Q5VWM4 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF8Q5VWM4 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF8Q5VWM4 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF8Q5VWM4 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF8Q5VWM4 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF8Q5VWM4 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF8Q5VWM4 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF8Q5VWM4 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF8Q5VWM4 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF8Q5VWM4 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF8Q5VWM4 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF8Q5VWM4 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF8Q5VWM4 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF8Q5VWM4 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF8Q5VWM4 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF8Q5VWM4 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF8Q5VWM4 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF8Q5VWM4 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF8Q5VWM4 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF8Q5VWM4 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF8Q5VWM4 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF8Q5VWM4 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF8Q5VWM4 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF8Q5VWM4 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF8Q5VWM4 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF8Q5VWM4 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF8Q5VWM4 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF8Q5VWM4 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF8Q5VWM4 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF8Q5VWM4 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF8Q5VWM4 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF8Q5VWM4 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF8Q5VWM4 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF8Q5VWM4 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF8Q5VWM4 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF8Q5VWM4 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF8Q5VWM4 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF8Q5VWM4 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF8Q5VWM4 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF8Q5VWM4 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF8Q5VWM4 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF8Q5VWM4 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF8Q5VWM4 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF8Q5VWM4 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF8Q5VWM4 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF8Q5VWM4 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF8Q5VWM4 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF8Q5VWM4 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF8Q5VWM4 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF8Q5VWM4 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF8Q5VWM4 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF8Q5VWM4 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF8Q5VWM4 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF8Q5VWM4 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF8Q5VWM4 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF8Q5VWM4 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF8Q5VWM4 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF8Q5VWM4 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF8Q5VWM4 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF8Q5VWM4 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF8Q5VWM4 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF8Q5VWM4 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF8Q5VWM4 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF8Q5VWM4 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF8Q5VWM4 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF8Q5VWM4 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF8Q5VWM4 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF8Q5VWM4 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF8Q5VWM4 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF8Q5VWM4 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF8Q5VWM4 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF8Q5VWM4 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF8Q5VWM4 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF8Q5VWM4 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF8Q5VWM4 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF8Q5VWM4 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF8Q5VWM4 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF8Q5VWM4 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF8Q5VWM4 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF8Q5VWM4 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF8Q5VWM4 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF8Q5VWM4 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF8Q5VWM4 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms