Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GARNL3Q5VVW2 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GARNL3Q5VVW2 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms