Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
FRMPD1Q5SYB0 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms