Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ALFQ53S48 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms