Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
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PDK4Q16654 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
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PDK4Q16654 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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