Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGCBQ16585 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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