Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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