Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZIC1Q15915 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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