Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP6AP1Q15904 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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