Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRADDQ15628 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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