Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NECTIN1Q15223 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
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NECTIN1Q15223 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
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NECTIN1Q15223 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
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NECTIN1Q15223 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
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NECTIN1Q15223 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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NECTIN1Q15223 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NECTIN1Q15223 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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