Protein–RNA interactions for Protein: Q14721

KCNB1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNB1Q14721 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
KCNB1Q14721 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KCNB1Q14721 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KCNB1Q14721 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KCNB1Q14721 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KCNB1Q14721 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KCNB1Q14721 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KCNB1Q14721 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
KCNB1Q14721 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KCNB1Q14721 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms