Protein–RNA interactions for Protein: Q13946

PDE7A, High affinity cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7A, humanhuman

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7AQ13946 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDE7AQ13946 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDE7AQ13946 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDE7AQ13946 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDE7AQ13946 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDE7AQ13946 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDE7AQ13946 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PDE7AQ13946 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDE7AQ13946 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDE7AQ13946 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDE7AQ13946 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDE7AQ13946 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDE7AQ13946 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDE7AQ13946 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDE7AQ13946 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDE7AQ13946 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDE7AQ13946 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDE7AQ13946 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDE7AQ13946 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDE7AQ13946 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDE7AQ13946 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDE7AQ13946 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDE7AQ13946 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDE7AQ13946 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDE7AQ13946 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDE7AQ13946 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDE7AQ13946 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDE7AQ13946 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDE7AQ13946 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDE7AQ13946 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDE7AQ13946 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDE7AQ13946 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PDE7AQ13946 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDE7AQ13946 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDE7AQ13946 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDE7AQ13946 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDE7AQ13946 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDE7AQ13946 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDE7AQ13946 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDE7AQ13946 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDE7AQ13946 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDE7AQ13946 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDE7AQ13946 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PDE7AQ13946 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDE7AQ13946 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDE7AQ13946 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDE7AQ13946 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDE7AQ13946 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDE7AQ13946 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDE7AQ13946 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDE7AQ13946 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDE7AQ13946 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDE7AQ13946 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDE7AQ13946 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDE7AQ13946 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDE7AQ13946 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDE7AQ13946 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDE7AQ13946 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDE7AQ13946 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDE7AQ13946 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDE7AQ13946 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDE7AQ13946 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDE7AQ13946 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDE7AQ13946 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDE7AQ13946 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDE7AQ13946 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDE7AQ13946 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDE7AQ13946 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDE7AQ13946 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDE7AQ13946 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDE7AQ13946 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDE7AQ13946 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDE7AQ13946 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDE7AQ13946 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDE7AQ13946 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDE7AQ13946 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDE7AQ13946 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDE7AQ13946 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDE7AQ13946 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDE7AQ13946 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDE7AQ13946 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDE7AQ13946 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDE7AQ13946 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDE7AQ13946 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PDE7AQ13946 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDE7AQ13946 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDE7AQ13946 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDE7AQ13946 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDE7AQ13946 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PDE7AQ13946 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDE7AQ13946 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDE7AQ13946 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDE7AQ13946 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDE7AQ13946 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDE7AQ13946 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDE7AQ13946 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDE7AQ13946 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDE7AQ13946 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDE7AQ13946 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDE7AQ13946 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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