Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDX39BQ13838 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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