Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

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Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MTMR3Q13615 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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