Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms