Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
C1orf61Q13536 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
C1orf61Q13536 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
C1orf61Q13536 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
C1orf61Q13536 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
C1orf61Q13536 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
C1orf61Q13536 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
C1orf61Q13536 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C1orf61Q13536 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C1orf61Q13536 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C1orf61Q13536 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C1orf61Q13536 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C1orf61Q13536 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C1orf61Q13536 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
C1orf61Q13536 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C1orf61Q13536 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C1orf61Q13536 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C1orf61Q13536 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C1orf61Q13536 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
C1orf61Q13536 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C1orf61Q13536 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C1orf61Q13536 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C1orf61Q13536 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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C1orf61Q13536 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
C1orf61Q13536 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C1orf61Q13536 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C1orf61Q13536 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C1orf61Q13536 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C1orf61Q13536 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C1orf61Q13536 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C1orf61Q13536 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C1orf61Q13536 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C1orf61Q13536 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C1orf61Q13536 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C1orf61Q13536 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C1orf61Q13536 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C1orf61Q13536 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C1orf61Q13536 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C1orf61Q13536 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C1orf61Q13536 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C1orf61Q13536 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C1orf61Q13536 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C1orf61Q13536 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C1orf61Q13536 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C1orf61Q13536 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C1orf61Q13536 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C1orf61Q13536 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C1orf61Q13536 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C1orf61Q13536 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C1orf61Q13536 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C1orf61Q13536 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C1orf61Q13536 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C1orf61Q13536 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C1orf61Q13536 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C1orf61Q13536 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C1orf61Q13536 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C1orf61Q13536 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C1orf61Q13536 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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