Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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