Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LSAMPQ13449 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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