Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM28Q13263 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM28Q13263 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM28Q13263 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM28Q13263 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM28Q13263 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM28Q13263 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM28Q13263 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM28Q13263 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM28Q13263 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM28Q13263 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM28Q13263 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM28Q13263 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM28Q13263 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM28Q13263 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM28Q13263 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM28Q13263 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM28Q13263 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM28Q13263 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM28Q13263 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM28Q13263 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM28Q13263 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM28Q13263 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM28Q13263 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM28Q13263 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM28Q13263 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM28Q13263 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM28Q13263 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM28Q13263 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM28Q13263 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM28Q13263 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM28Q13263 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM28Q13263 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM28Q13263 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM28Q13263 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM28Q13263 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM28Q13263 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM28Q13263 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM28Q13263 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM28Q13263 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM28Q13263 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM28Q13263 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM28Q13263 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM28Q13263 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM28Q13263 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM28Q13263 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM28Q13263 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM28Q13263 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM28Q13263 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM28Q13263 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM28Q13263 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM28Q13263 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM28Q13263 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM28Q13263 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM28Q13263 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM28Q13263 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM28Q13263 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM28Q13263 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM28Q13263 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM28Q13263 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM28Q13263 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM28Q13263 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM28Q13263 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM28Q13263 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM28Q13263 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM28Q13263 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM28Q13263 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM28Q13263 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM28Q13263 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM28Q13263 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM28Q13263 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM28Q13263 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM28Q13263 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM28Q13263 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM28Q13263 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM28Q13263 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM28Q13263 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM28Q13263 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM28Q13263 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM28Q13263 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM28Q13263 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM28Q13263 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM28Q13263 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM28Q13263 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM28Q13263 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM28Q13263 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM28Q13263 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM28Q13263 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM28Q13263 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM28Q13263 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
TRIM28Q13263 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
TRIM28Q13263 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
TRIM28Q13263 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM28Q13263 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM28Q13263 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM28Q13263 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM28Q13263 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM28Q13263 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM28Q13263 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM28Q13263 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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