Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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