Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP4Q09028 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms