Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms