Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SOX4Q06945 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms