Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GCNT1Q02742 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms