Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXOSC10Q01780 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms